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幾何学で読む抗ウイルス設計の余地:SARS‑CoV‑2 DMV ポア外面の形態力学と小分子の影響

コロナの巣の出入り口を狭める物質の検証に成功しました。滅茶苦茶しつこいのに研究が進んでいないコロナの巣(DMV)に関するネイチャーの二つの最新論文から、外からアクセスできる通用口(王冠)が一つだけあることに着目。まだほとんど解明の進んでいない第二の王冠の一部をAlphafold2で自前シミュレーションし、ウイルスが巣から出しがちな物質を模倣することで誤情報をおくることで、通用路の直径を狭められることがわかりました。今回のレポートではその結果をまとめています。コロナウイルスが立てこもり、中でコピーを続けながらしつこい炎症の原因になると推定される巣に、形状の変化を促すという新規視点で初めて正面から取り組みました。(商品ページに続く)

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筆者紹介

首都圏の国立大学で情報処理を専攻し、日系および英国系シンクタンクで情報分析、電機メーカーで戦略データ分析に従事。その後、2011年に海外移住し、原発事故関連のデータ収集を行いました。

現在は、GPUを活用した独自のパイプラインを構築し、分子ドッキング試験と分子動力学シミュレーションを実施。AIモデル(GPTなど)による認知機能解析と統合し、COVID-19回復や神経機能に関連する分子メカニズムを探究しています。

ルーマニアの神経栄養学者やハーバードのスタートアップと連携し、最先端の科学的知見をこのサイトで提供。科学的アプローチを基に、分子レベルの理解を深め、実用的な洞察を届けます。

現地COVID対策本部に助言。

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